Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX1P83916 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX1P83916 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX1P83916 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX1P83916 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBX1P83916 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBX1P83916 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBX1P83916 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX1P83916 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX1P83916 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX1P83916 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX1P83916 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX1P83916 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX1P83916 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX1P83916 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX1P83916 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX1P83916 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX1P83916 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX1P83916 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX1P83916 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX1P83916 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX1P83916 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX1P83916 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX1P83916 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX1P83916 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX1P83916 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX1P83916 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX1P83916 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX1P83916 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX1P83916 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX1P83916 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX1P83916 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX1P83916 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX1P83916 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX1P83916 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX1P83916 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX1P83916 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX1P83916 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX1P83916 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX1P83916 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX1P83916 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX1P83916 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX1P83916 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX1P83916 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX1P83916 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX1P83916 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX1P83916 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX1P83916 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX1P83916 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX1P83916 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX1P83916 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX1P83916 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX1P83916 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX1P83916 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX1P83916 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX1P83916 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX1P83916 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX1P83916 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX1P83916 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX1P83916 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX1P83916 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX1P83916 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX1P83916 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX1P83916 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX1P83916 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX1P83916 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX1P83916 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX1P83916 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX1P83916 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX1P83916 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX1P83916 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms