Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMF1P82094 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMF1P82094 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMF1P82094 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMF1P82094 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMF1P82094 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TMF1P82094 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TMF1P82094 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TMF1P82094 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TMF1P82094 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TMF1P82094 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TMF1P82094 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TMF1P82094 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TMF1P82094 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TMF1P82094 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TMF1P82094 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMF1P82094 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMF1P82094 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMF1P82094 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMF1P82094 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMF1P82094 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMF1P82094 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMF1P82094 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMF1P82094 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMF1P82094 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMF1P82094 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TMF1P82094 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMF1P82094 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
TMF1P82094 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
TMF1P82094 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMF1P82094 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMF1P82094 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMF1P82094 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMF1P82094 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMF1P82094 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMF1P82094 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMF1P82094 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMF1P82094 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMF1P82094 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMF1P82094 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMF1P82094 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMF1P82094 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMF1P82094 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMF1P82094 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMF1P82094 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMF1P82094 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMF1P82094 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMF1P82094 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMF1P82094 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMF1P82094 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TMF1P82094 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TMF1P82094 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TMF1P82094 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TMF1P82094 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TMF1P82094 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TMF1P82094 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMF1P82094 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMF1P82094 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMF1P82094 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMF1P82094 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TMF1P82094 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMF1P82094 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMF1P82094 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMF1P82094 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TMF1P82094 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMF1P82094 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
TMF1P82094 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMF1P82094 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMF1P82094 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMF1P82094 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMF1P82094 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMF1P82094 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMF1P82094 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMF1P82094 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
TMF1P82094 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMF1P82094 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMF1P82094 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMF1P82094 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMF1P82094 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMF1P82094 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMF1P82094 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMF1P82094 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMF1P82094 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMF1P82094 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMF1P82094 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMF1P82094 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TMF1P82094 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMF1P82094 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMF1P82094 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMF1P82094 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMF1P82094 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMF1P82094 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMF1P82094 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TMF1P82094 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMF1P82094 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMF1P82094 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMF1P82094 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TMF1P82094 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TMF1P82094 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
TMF1P82094 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms