Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BP2P78314 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms