Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL11P62913 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL11P62913 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL11P62913 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL11P62913 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL11P62913 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL11P62913 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL11P62913 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL11P62913 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL11P62913 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL11P62913 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL11P62913 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL11P62913 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL11P62913 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL11P62913 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL11P62913 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL11P62913 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL11P62913 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL11P62913 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL11P62913 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL11P62913 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL11P62913 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL11P62913 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL11P62913 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL11P62913 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL11P62913 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL11P62913 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL11P62913 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL11P62913 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL11P62913 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL11P62913 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL11P62913 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL11P62913 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL11P62913 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL11P62913 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL11P62913 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL11P62913 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL11P62913 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL11P62913 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL11P62913 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL11P62913 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL11P62913 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL11P62913 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL11P62913 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL11P62913 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL11P62913 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL11P62913 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL11P62913 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL11P62913 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL11P62913 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL11P62913 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL11P62913 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL11P62913 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms