Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3EP60228 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms