Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3BP58499 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3BP58499 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms