Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA1P56199 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms