Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SUMO3P55854 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUMO3P55854 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUMO3P55854 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms