Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP9P55211 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP9P55211 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP9P55211 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP9P55211 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP9P55211 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP9P55211 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP9P55211 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP9P55211 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP9P55211 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP9P55211 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP9P55211 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP9P55211 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP9P55211 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP9P55211 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP9P55211 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP9P55211 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP9P55211 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP9P55211 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP9P55211 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP9P55211 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP9P55211 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP9P55211 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP9P55211 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP9P55211 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP9P55211 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP9P55211 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP9P55211 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP9P55211 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP9P55211 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP9P55211 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP9P55211 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP9P55211 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP9P55211 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP9P55211 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP9P55211 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP9P55211 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP9P55211 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP9P55211 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP9P55211 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP9P55211 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP9P55211 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP9P55211 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP9P55211 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP9P55211 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP9P55211 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP9P55211 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP9P55211 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP9P55211 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP9P55211 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP9P55211 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CASP9P55211 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP9P55211 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP9P55211 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP9P55211 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP9P55211 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP9P55211 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP9P55211 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP9P55211 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP9P55211 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP9P55211 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP9P55211 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP9P55211 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP9P55211 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP9P55211 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP9P55211 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP9P55211 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP9P55211 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP9P55211 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP9P55211 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP9P55211 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP9P55211 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP9P55211 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP9P55211 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP9P55211 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP9P55211 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP9P55211 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP9P55211 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP9P55211 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP9P55211 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP9P55211 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CASP9P55211 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP9P55211 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP9P55211 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP9P55211 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP9P55211 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP9P55211 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms