Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 PTR2YKR093W 1806 nt5.48□□□□□ -1.53
HEF3P53978 ECM7YLR443W 1347 nt5.48□□□□□ -1.53
HEF3P53978 FOX2YKR009C 2703 nt5.47□□□□□ -1.53
HEF3P53978 OCA4YCR095C 1089 nt5.47□□□□□ -1.53
HEF3P53978 RIP1YEL024W 648 nt5.47□□□□□ -1.53
HEF3P53978 ISY1YJR050W 708 nt5.47□□□□□ -1.53
HEF3P53978 NTR2YKR022C 969 nt5.47□□□□□ -1.53
HEF3P53978 TVP38YKR088C 1014 nt5.47□□□□□ -1.53
HEF3P53978 NMD4YLR363C 657 nt5.47□□□□□ -1.53
HEF3P53978 COG5YNL051W 1212 nt5.47□□□□□ -1.53
HEF3P53978 RRP40YOL142W 723 nt5.47□□□□□ -1.53
HEF3P53978 YPR071WYPR071W 636 nt5.47□□□□□ -1.53
HEF3P53978 GDB1YPR184W 4611 nt5.47□□□□□ -1.53
HEF3P53978 EIS1YMR031C 2532 nt5.47□□□□□ -1.53
HEF3P53978 MKS1YNL076W 1755 nt5.47□□□□□ -1.53
HEF3P53978 BSC5YNR069C 1470 nt5.46□□□□□ -1.53
HEF3P53978 ATR1YML116W 1629 nt5.46□□□□□ -1.54
HEF3P53978 LYS5YGL154C 819 nt5.46□□□□□ -1.54
HEF3P53978 VAM7YGL212W 951 nt5.46□□□□□ -1.54
HEF3P53978 GPP1YIL053W 753 nt5.46□□□□□ -1.54
HEF3P53978 YOR379CYOR379C 339 nt5.46□□□□□ -1.54
HEF3P53978 COA2YPL189C-A 207 nt5.46□□□□□ -1.54
HEF3P53978 YMR221CYMR221C 1515 nt5.46□□□□□ -1.54
HEF3P53978 YIL001WYIL001W 1542 nt5.45□□□□□ -1.54
HEF3P53978 TSL1YML100W 3297 nt5.45□□□□□ -1.54
HEF3P53978 PER1YCR044C 1074 nt5.45□□□□□ -1.54
HEF3P53978 ADK2YER170W 678 nt5.45□□□□□ -1.54
HEF3P53978 RNA15YGL044C 891 nt5.45□□□□□ -1.54
HEF3P53978 YGR291CYGR291C 222 nt5.45□□□□□ -1.54
HEF3P53978 MRPL24YMR193W 777 nt5.45□□□□□ -1.54
HEF3P53978 snR32snR32 188 nt5.45□□□□□ -1.54
HEF3P53978 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.45□□□□□ -1.54
HEF3P53978 RER1YCL001W 567 nt5.45□□□□□ -1.54
HEF3P53978 LYP1YNL268W 1836 nt5.45□□□□□ -1.54
HEF3P53978 PHM7YOL084W 2976 nt5.45□□□□□ -1.54
HEF3P53978 IMA3YIL172C 1770 nt5.44□□□□□ -1.54
HEF3P53978 IMA4YJL221C 1770 nt5.44□□□□□ -1.54
HEF3P53978 GSY1YFR015C 2127 nt5.44□□□□□ -1.54
HEF3P53978 SUR2YDR297W 1050 nt5.44□□□□□ -1.54
HEF3P53978 HXT7YDR342C 1713 nt5.44□□□□□ -1.54
HEF3P53978 HXT6YDR343C 1713 nt5.44□□□□□ -1.54
HEF3P53978 COX18YGR062C 951 nt5.44□□□□□ -1.54
HEF3P53978 ARC40YBR234C 1155 nt5.44□□□□□ -1.54
HEF3P53978 YNL095CYNL095C 1929 nt5.44□□□□□ -1.54
HEF3P53978 DIT1YDR403W 1611 nt5.44□□□□□ -1.54
HEF3P53978 BUD14YAR014C 2130 nt5.44□□□□□ -1.54
HEF3P53978 CTS2YDR371W 1536 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 TDA7YNL176C 1911 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 RRP1YDR087C 837 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 PEX7YDR142C 1128 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 PHA2YNL316C 1005 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 TIF5YPR041W 1218 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 EAR1YMR171C 1653 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 RPN5YDL147W 1338 nt5.43□□□□□ -1.54
HEF3P53978 CYM1YDR430C 2970 nt5.42□□□□□ -1.54
HEF3P53978 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt5.42□□□□□ -1.54
HEF3P53978 TEF4YKL081W 1239 nt5.42□□□□□ -1.54
HEF3P53978 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt5.42□□□□□ -1.54
HEF3P53978 YNG1YOR064C 660 nt5.42□□□□□ -1.54
HEF3P53978 YBR138CYBR138C 1575 nt5.42□□□□□ -1.54
HEF3P53978 MET4YNL103W 2019 nt5.41□□□□□ -1.54
HEF3P53978 PEX29YDR479C 1665 nt5.41□□□□□ -1.54
HEF3P53978 RHO3YIL118W 696 nt5.41□□□□□ -1.54
HEF3P53978 LOH1YJL038C 660 nt5.41□□□□□ -1.54
HEF3P53978 FMP46YKR049C 402 nt5.41□□□□□ -1.54
HEF3P53978 YIM1YMR152W 1098 nt5.41□□□□□ -1.54
HEF3P53978 PDX3YBR035C 687 nt5.41□□□□□ -1.54
HEF3P53978 NUP2YLR335W 2163 nt5.4□□□□□ -1.54
HEF3P53978 GDH2YDL215C 3279 nt5.4□□□□□ -1.54
HEF3P53978 snR7-SsnR7-S 179 nt5.4□□□□□ -1.54
HEF3P53978 MCX1YBR227C 1563 nt5.4□□□□□ -1.55
HEF3P53978 RPN6YDL097C 1305 nt5.4□□□□□ -1.55
HEF3P53978 PMA1YGL008C 2757 nt5.39□□□□□ -1.55
HEF3P53978 SPC97YHR172W 2472 nt5.39□□□□□ -1.55
HEF3P53978 YOL079WYOL079W 399 nt5.39□□□□□ -1.55
HEF3P53978 YPL071CYPL071C 471 nt5.39□□□□□ -1.55
HEF3P53978 ALG5YPL227C 1005 nt5.39□□□□□ -1.55
HEF3P53978 STB3YDR169C 1542 nt5.38□□□□□ -1.55
HEF3P53978 PEP5YMR231W 3090 nt5.38□□□□□ -1.55
HEF3P53978 CTT1YGR088W 1689 nt5.38□□□□□ -1.55
HEF3P53978 JHD2YJR119C 2187 nt5.38□□□□□ -1.55
HEF3P53978 COQ4YDR204W 1008 nt5.38□□□□□ -1.55
HEF3P53978 API2YDR525W 330 nt5.38□□□□□ -1.55
HEF3P53978 FRA2YGL220W 363 nt5.38□□□□□ -1.55
HEF3P53978 RRN9YMR270C 1098 nt5.38□□□□□ -1.55
HEF3P53978 MED4YOR174W 855 nt5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 933.4 ms