Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A3P53794 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A3P53794 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms