Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUBP1P53384 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms