Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDST1P52848 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST1P52848 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST1P52848 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST1P52848 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST1P52848 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST1P52848 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST1P52848 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST1P52848 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST1P52848 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST1P52848 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST1P52848 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST1P52848 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST1P52848 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST1P52848 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST1P52848 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST1P52848 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST1P52848 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST1P52848 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST1P52848 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST1P52848 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST1P52848 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST1P52848 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST1P52848 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST1P52848 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST1P52848 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST1P52848 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST1P52848 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST1P52848 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST1P52848 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST1P52848 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST1P52848 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST1P52848 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST1P52848 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDST1P52848 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDST1P52848 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST1P52848 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST1P52848 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST1P52848 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST1P52848 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST1P52848 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST1P52848 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST1P52848 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST1P52848 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST1P52848 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST1P52848 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST1P52848 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST1P52848 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST1P52848 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST1P52848 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST1P52848 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST1P52848 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST1P52848 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST1P52848 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST1P52848 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST1P52848 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST1P52848 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST1P52848 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST1P52848 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST1P52848 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST1P52848 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST1P52848 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST1P52848 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST1P52848 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST1P52848 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST1P52848 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST1P52848 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST1P52848 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST1P52848 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST1P52848 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST1P52848 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST1P52848 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms