Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA3P51805 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms