Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB27AP51159 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms