Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGS4P49798 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGS4P49798 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGS4P49798 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGS4P49798 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGS4P49798 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGS4P49798 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RGS4P49798 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGS4P49798 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGS4P49798 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGS4P49798 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGS4P49798 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGS4P49798 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGS4P49798 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGS4P49798 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGS4P49798 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGS4P49798 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGS4P49798 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGS4P49798 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGS4P49798 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGS4P49798 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGS4P49798 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGS4P49798 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGS4P49798 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGS4P49798 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGS4P49798 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGS4P49798 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGS4P49798 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGS4P49798 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGS4P49798 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGS4P49798 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGS4P49798 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGS4P49798 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGS4P49798 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGS4P49798 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGS4P49798 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGS4P49798 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGS4P49798 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGS4P49798 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGS4P49798 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGS4P49798 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGS4P49798 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGS4P49798 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RGS4P49798 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGS4P49798 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGS4P49798 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms