Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT3P49368 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT3P49368 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT3P49368 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT3P49368 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT3P49368 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT3P49368 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT3P49368 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT3P49368 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT3P49368 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT3P49368 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT3P49368 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT3P49368 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT3P49368 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT3P49368 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT3P49368 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT3P49368 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT3P49368 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT3P49368 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT3P49368 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT3P49368 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT3P49368 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT3P49368 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCT3P49368 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCT3P49368 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT3P49368 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCT3P49368 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCT3P49368 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT3P49368 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT3P49368 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCT3P49368 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCT3P49368 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT3P49368 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT3P49368 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT3P49368 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT3P49368 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT3P49368 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCT3P49368 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCT3P49368 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCT3P49368 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT3P49368 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCT3P49368 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCT3P49368 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT3P49368 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT3P49368 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCT3P49368 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT3P49368 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT3P49368 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT3P49368 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT3P49368 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT3P49368 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT3P49368 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT3P49368 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT3P49368 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT3P49368 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT3P49368 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT3P49368 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT3P49368 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT3P49368 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT3P49368 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT3P49368 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCT3P49368 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCT3P49368 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCT3P49368 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCT3P49368 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCT3P49368 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCT3P49368 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCT3P49368 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCT3P49368 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCT3P49368 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCT3P49368 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT3P49368 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT3P49368 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT3P49368 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT3P49368 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT3P49368 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT3P49368 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT3P49368 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT3P49368 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT3P49368 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT3P49368 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT3P49368 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT3P49368 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT3P49368 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT3P49368 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT3P49368 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms