Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRPC1P48995 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms