Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRIP1P48552 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms