Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms