Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCN1P48444 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms