Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms