Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRXP46100 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRXP46100 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRXP46100 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRXP46100 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRXP46100 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRXP46100 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRXP46100 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRXP46100 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRXP46100 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRXP46100 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRXP46100 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRXP46100 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRXP46100 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRXP46100 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRXP46100 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRXP46100 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRXP46100 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRXP46100 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRXP46100 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRXP46100 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRXP46100 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRXP46100 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRXP46100 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRXP46100 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRXP46100 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRXP46100 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRXP46100 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRXP46100 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRXP46100 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRXP46100 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRXP46100 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRXP46100 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRXP46100 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRXP46100 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRXP46100 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRXP46100 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRXP46100 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRXP46100 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRXP46100 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRXP46100 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRXP46100 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRXP46100 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRXP46100 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRXP46100 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRXP46100 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRXP46100 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRXP46100 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRXP46100 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRXP46100 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRXP46100 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ATRXP46100 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRXP46100 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRXP46100 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRXP46100 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRXP46100 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRXP46100 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRXP46100 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRXP46100 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRXP46100 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRXP46100 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRXP46100 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRXP46100 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRXP46100 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRXP46100 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRXP46100 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRXP46100 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRXP46100 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRXP46100 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRXP46100 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRXP46100 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRXP46100 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRXP46100 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRXP46100 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRXP46100 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRXP46100 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRXP46100 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRXP46100 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRXP46100 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRXP46100 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRXP46100 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRXP46100 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRXP46100 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRXP46100 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRXP46100 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRXP46100 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRXP46100 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms