Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RANGAP1P46060 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RANGAP1P46060 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RANGAP1P46060 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms