Protein–RNA interactions for Protein: P43489

TNFRSF4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF4P43489 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF4P43489 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF4P43489 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms