Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGIRP43119 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGIRP43119 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms