Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHMBP2P38935 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHMBP2P38935 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGHMBP2P38935 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHMBP2P38935 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHMBP2P38935 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHMBP2P38935 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHMBP2P38935 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHMBP2P38935 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHMBP2P38935 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHMBP2P38935 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHMBP2P38935 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
IGHMBP2P38935 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms