Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FDFT1P37268 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FDFT1P37268 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms