Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF1P36956 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF1P36956 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms