Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM23P36406 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms