Protein–RNA interactions for Protein: P35998

PSMC2, 26S proteasome regulatory subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC2P35998 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMC2P35998 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC2P35998 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms