Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGCLP35914 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCLP35914 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCLP35914 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms