Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER1P34995 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms