Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSP1P33241 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSP1P33241 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSP1P33241 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSP1P33241 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSP1P33241 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSP1P33241 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LSP1P33241 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSP1P33241 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSP1P33241 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSP1P33241 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LSP1P33241 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSP1P33241 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSP1P33241 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSP1P33241 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSP1P33241 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSP1P33241 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSP1P33241 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSP1P33241 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSP1P33241 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSP1P33241 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSP1P33241 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSP1P33241 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSP1P33241 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSP1P33241 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSP1P33241 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSP1P33241 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSP1P33241 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSP1P33241 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LSP1P33241 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSP1P33241 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSP1P33241 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSP1P33241 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSP1P33241 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSP1P33241 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSP1P33241 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSP1P33241 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSP1P33241 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSP1P33241 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSP1P33241 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LSP1P33241 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSP1P33241 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSP1P33241 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSP1P33241 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSP1P33241 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSP1P33241 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSP1P33241 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSP1P33241 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSP1P33241 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSP1P33241 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSP1P33241 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSP1P33241 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSP1P33241 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSP1P33241 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSP1P33241 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSP1P33241 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSP1P33241 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSP1P33241 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSP1P33241 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSP1P33241 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSP1P33241 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSP1P33241 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSP1P33241 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LSP1P33241 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSP1P33241 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSP1P33241 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSP1P33241 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSP1P33241 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSP1P33241 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSP1P33241 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSP1P33241 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LSP1P33241 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSP1P33241 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSP1P33241 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSP1P33241 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSP1P33241 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LSP1P33241 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSP1P33241 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSP1P33241 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LSP1P33241 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSP1P33241 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSP1P33241 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSP1P33241 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSP1P33241 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSP1P33241 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSP1P33241 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSP1P33241 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSP1P33241 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSP1P33241 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSP1P33241 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSP1P33241 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms