Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF1P30408 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1345.1 ms