Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH4A1P30038 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALDH4A1P30038 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH4A1P30038 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms