Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMBRP28336 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMBRP28336 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMBRP28336 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMBRP28336 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMBRP28336 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMBRP28336 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMBRP28336 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMBRP28336 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMBRP28336 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMBRP28336 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMBRP28336 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMBRP28336 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMBRP28336 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMBRP28336 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMBRP28336 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMBRP28336 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMBRP28336 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMBRP28336 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMBRP28336 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMBRP28336 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMBRP28336 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMBRP28336 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMBRP28336 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMBRP28336 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMBRP28336 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBRP28336 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NMBRP28336 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMBRP28336 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMBRP28336 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMBRP28336 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMBRP28336 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMBRP28336 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NMBRP28336 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMBRP28336 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMBRP28336 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMBRP28336 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMBRP28336 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMBRP28336 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMBRP28336 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMBRP28336 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NMBRP28336 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMBRP28336 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMBRP28336 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMBRP28336 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMBRP28336 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMBRP28336 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMBRP28336 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMBRP28336 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMBRP28336 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMBRP28336 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMBRP28336 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMBRP28336 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMBRP28336 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMBRP28336 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMBRP28336 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMBRP28336 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NMBRP28336 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBRP28336 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBRP28336 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBRP28336 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBRP28336 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBRP28336 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBRP28336 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBRP28336 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBRP28336 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBRP28336 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBRP28336 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBRP28336 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBRP28336 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBRP28336 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBRP28336 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBRP28336 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms