Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX2P28328 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX2P28328 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX2P28328 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX2P28328 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX2P28328 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX2P28328 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX2P28328 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX2P28328 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX2P28328 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX2P28328 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX2P28328 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PEX2P28328 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PEX2P28328 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PEX2P28328 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PEX2P28328 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX2P28328 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX2P28328 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX2P28328 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX2P28328 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX2P28328 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX2P28328 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX2P28328 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PEX2P28328 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX2P28328 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX2P28328 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX2P28328 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX2P28328 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX2P28328 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX2P28328 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX2P28328 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX2P28328 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX2P28328 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX2P28328 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX2P28328 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX2P28328 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX2P28328 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX2P28328 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PEX2P28328 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX2P28328 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX2P28328 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX2P28328 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX2P28328 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PEX2P28328 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEX2P28328 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PEX2P28328 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PEX2P28328 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX2P28328 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX2P28328 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PEX2P28328 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX2P28328 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX2P28328 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX2P28328 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX2P28328 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX2P28328 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX2P28328 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PEX2P28328 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX2P28328 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEX2P28328 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX2P28328 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX2P28328 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX2P28328 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX2P28328 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX2P28328 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX2P28328 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX2P28328 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX2P28328 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PEX2P28328 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PEX2P28328 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX2P28328 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PEX2P28328 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX2P28328 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX2P28328 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PEX2P28328 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEX2P28328 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PEX2P28328 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PEX2P28328 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PEX2P28328 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PEX2P28328 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PEX2P28328 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX2P28328 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX2P28328 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX2P28328 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX2P28328 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX2P28328 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms