Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HTR2AP28223 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HTR2AP28223 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms