Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA3P26006 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA3P26006 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms