Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX3P23760 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX3P23760 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX3P23760 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX3P23760 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX3P23760 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAX3P23760 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAX3P23760 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAX3P23760 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAX3P23760 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAX3P23760 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PAX3P23760 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAX3P23760 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAX3P23760 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAX3P23760 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAX3P23760 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAX3P23760 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAX3P23760 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAX3P23760 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PAX3P23760 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAX3P23760 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAX3P23760 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAX3P23760 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAX3P23760 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAX3P23760 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAX3P23760 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAX3P23760 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAX3P23760 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAX3P23760 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PAX3P23760 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAX3P23760 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAX3P23760 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PAX3P23760 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PAX3P23760 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAX3P23760 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAX3P23760 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAX3P23760 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PAX3P23760 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAX3P23760 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAX3P23760 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX3P23760 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX3P23760 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX3P23760 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX3P23760 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX3P23760 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX3P23760 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX3P23760 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX3P23760 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX3P23760 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX3P23760 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX3P23760 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX3P23760 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX3P23760 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX3P23760 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX3P23760 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX3P23760 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX3P23760 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX3P23760 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX3P23760 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX3P23760 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX3P23760 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX3P23760 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX3P23760 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX3P23760 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX3P23760 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX3P23760 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX3P23760 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX3P23760 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX3P23760 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAX3P23760 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX3P23760 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX3P23760 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX3P23760 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX3P23760 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX3P23760 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX3P23760 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX3P23760 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX3P23760 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX3P23760 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX3P23760 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX3P23760 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX3P23760 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX3P23760 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX3P23760 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX3P23760 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX3P23760 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX3P23760 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX3P23760 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX3P23760 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX3P23760 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX3P23760 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX3P23760 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX3P23760 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX3P23760 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX3P23760 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX3P23760 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX3P23760 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX3P23760 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX3P23760 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX3P23760 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms