Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME2P23368 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME2P23368 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME2P23368 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME2P23368 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME2P23368 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME2P23368 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME2P23368 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME2P23368 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME2P23368 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME2P23368 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME2P23368 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME2P23368 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME2P23368 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME2P23368 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME2P23368 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME2P23368 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME2P23368 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME2P23368 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME2P23368 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME2P23368 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME2P23368 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME2P23368 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME2P23368 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME2P23368 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME2P23368 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME2P23368 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME2P23368 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ME2P23368 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME2P23368 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME2P23368 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME2P23368 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME2P23368 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME2P23368 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ME2P23368 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME2P23368 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ME2P23368 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME2P23368 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME2P23368 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME2P23368 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME2P23368 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME2P23368 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME2P23368 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME2P23368 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME2P23368 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME2P23368 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME2P23368 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME2P23368 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME2P23368 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME2P23368 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME2P23368 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME2P23368 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME2P23368 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms