Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH3P22223 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH3P22223 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH3P22223 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH3P22223 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH3P22223 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH3P22223 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH3P22223 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH3P22223 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH3P22223 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH3P22223 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH3P22223 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH3P22223 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH3P22223 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH3P22223 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH3P22223 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH3P22223 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH3P22223 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH3P22223 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH3P22223 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH3P22223 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH3P22223 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH3P22223 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH3P22223 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH3P22223 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH3P22223 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH3P22223 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH3P22223 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH3P22223 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH3P22223 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH3P22223 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH3P22223 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH3P22223 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH3P22223 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH3P22223 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH3P22223 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH3P22223 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH3P22223 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH3P22223 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH3P22223 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH3P22223 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH3P22223 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH3P22223 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH3P22223 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH3P22223 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH3P22223 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH3P22223 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH3P22223 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH3P22223 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH3P22223 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH3P22223 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH3P22223 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH3P22223 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH3P22223 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH3P22223 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH3P22223 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH3P22223 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH3P22223 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH3P22223 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH3P22223 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms