Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD247P20963 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD247P20963 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD247P20963 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CD247P20963 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD247P20963 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD247P20963 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD247P20963 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD247P20963 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD247P20963 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD247P20963 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD247P20963 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD247P20963 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD247P20963 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD247P20963 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CD247P20963 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD247P20963 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD247P20963 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD247P20963 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CD247P20963 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CD247P20963 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD247P20963 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD247P20963 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD247P20963 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD247P20963 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD247P20963 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD247P20963 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD247P20963 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CD247P20963 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD247P20963 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD247P20963 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD247P20963 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD247P20963 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD247P20963 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD247P20963 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD247P20963 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD247P20963 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD247P20963 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD247P20963 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD247P20963 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD247P20963 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CD247P20963 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD247P20963 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD247P20963 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD247P20963 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD247P20963 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD247P20963 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CD247P20963 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD247P20963 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD247P20963 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD247P20963 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD247P20963 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD247P20963 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD247P20963 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD247P20963 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD247P20963 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD247P20963 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD247P20963 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD247P20963 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD247P20963 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD247P20963 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD247P20963 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD247P20963 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD247P20963 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD247P20963 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD247P20963 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CD247P20963 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD247P20963 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD247P20963 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD247P20963 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD247P20963 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CD247P20963 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD247P20963 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD247P20963 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD247P20963 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD247P20963 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD247P20963 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD247P20963 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD247P20963 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD247P20963 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms