Protein–RNA interactions for Protein: P20424

SRP54, Signal recognition particle subunit SRP54, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP54P20424 NFI1YOR156C 2181 nt5.38□□□□□ -1.55
SRP54P20424 REX3YLR107W 1215 nt5.38□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.38□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YIF1YNL263C 945 nt5.38□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.38□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.38□□□□□ -1.55
SRP54P20424 MPC54YOR177C 1395 nt5.38□□□□□ -1.55
SRP54P20424 LAP2YNL045W 2016 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP54P20424 GDE1YPL110C 3672 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP54P20424 RPC19YNL113W 429 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP54P20424 TRS33YOR115C 807 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP54P20424 OAZ1YPL052W 879 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP54P20424 ARR1YPR199C 885 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP54P20424 ATG14YBR128C 1035 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP54P20424 THI20YOL055C 1656 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP54P20424 SNF3YDL194W 2655 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP54P20424 EDC1YGL222C 528 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YHR095WYHR095W 495 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP54P20424 NPT1YOR209C 1290 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YPR109WYPR109W 885 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP54P20424 UTP9YHR196W 1728 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YLH47YPR125W 1365 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP54P20424 ASA1YPR085C 1332 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP54P20424 MED2YDL005C 1296 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YEL028WYEL028W 462 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP54P20424 NMA1YLR328W 1206 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP54P20424 QCR2YPR191W 1107 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP54P20424 NUP1YOR098C 3231 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP54P20424 SWI3YJL176C 2478 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP54P20424 FRE7YOL152W 1863 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YPL260WYPL260W 1656 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP54P20424 BUD22YMR014W 1560 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP54P20424 RRP3YHR065C 1506 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP54P20424 HST4YDR191W 1113 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP54P20424 PAD1YDR538W 729 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP54P20424 RPL28YGL103W 450 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP54P20424 SKI8YGL213C 1194 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP54P20424 CCS1YMR038C 750 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP54P20424 MDR1YGR100W 2853 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP54P20424 ESF1YDR365C 1887 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YGR016WYGR016W 573 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP54P20424 YGR153WYGR153W 654 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP54P20424 MNN11YJL183W 1269 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP54P20424 YKL169CYKL169C 384 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP54P20424 PRP28YDR243C 1767 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP54P20424 SLD2YKL108W 1362 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP54P20424 PSY4YBL046W 1326 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP54P20424 MNT2YGL257C 1677 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP54P20424 MPC1YGL080W 393 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP54P20424 CPR6YLR216C 1116 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP54P20424 YBL029WYBL029W 1131 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP54P20424 GCN20YFR009W 2259 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP54P20424 ATH1YPR026W 3636 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP54P20424 STP4YDL048C 1473 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP54P20424 FUM1YPL262W 1467 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP54P20424 YGR266WYGR266W 2106 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP54P20424 PUT1YLR142W 1431 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP54P20424 MSE1YOL033W 1611 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP54P20424 UBX7YBR273C 1311 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP54P20424 ADD66YKL206C 804 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP54P20424 YLR402WYLR402W 192 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP54P20424 POS5YPL188W 1245 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP54P20424 PEX32YBR168W 1242 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP54P20424 FHL1YPR104C 2811 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP54P20424 TDA6YPR157W 1404 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP54P20424 KRE6YPR159W 2163 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP54P20424 GIP2YER054C 1647 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP54P20424 DXO1YDR370C 1329 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP54P20424 LSM6YDR378C 261 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP54P20424 YNL134CYNL134C 1131 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP54P20424 SLZ1YNL196C 897 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP54P20424 SAF1YBR280C 1914 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP54P20424 KAP114YGL241W 3015 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP54P20424 YEH2YLR020C 1617 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP54P20424 KCH1YJR054W 1494 nt5.29□□□□□ -1.56
SRP54P20424 UBC6YER100W 753 nt5.29□□□□□ -1.56
SRP54P20424 LYS5YGL154C 819 nt5.29□□□□□ -1.56
SRP54P20424 YJR012CYJR012C 624 nt5.29□□□□□ -1.56
SRP54P20424 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.29□□□□□ -1.56
SRP54P20424 NCE103YNL036W 666 nt5.29□□□□□ -1.56
SRP54P20424 YOL050CYOL050C 321 nt5.29□□□□□ -1.56
SRP54P20424 PDR10YOR328W 4695 nt5.29□□□□□ -1.56
SRP54P20424 HXT7YDR342C 1713 nt5.28□□□□□ -1.56
SRP54P20424 HXT6YDR343C 1713 nt5.28□□□□□ -1.56
SRP54P20424 TRM44YPL030W 1704 nt5.28□□□□□ -1.56
SRP54P20424 SAP30YMR263W 606 nt5.28□□□□□ -1.56
SRP54P20424 URE2YNL229C 1065 nt5.28□□□□□ -1.56
SRP54P20424 HIR2YOR038C 2628 nt5.28□□□□□ -1.56
SRP54P20424 MRE11YMR224C 2079 nt5.28□□□□□ -1.56
SRP54P20424 IML2YJL082W 2196 nt5.28□□□□□ -1.56
SRP54P20424 EMP46YLR080W 1335 nt5.27□□□□□ -1.57
SRP54P20424 RAD30YDR419W 1899 nt5.27□□□□□ -1.57
SRP54P20424 ERG4YGL012W 1422 nt5.27□□□□□ -1.57
SRP54P20424 ADD37YMR184W 597 nt5.27□□□□□ -1.57
SRP54P20424 RAD17YOR368W 1206 nt5.27□□□□□ -1.57
SRP54P20424 HOS1YPR068C 1413 nt5.27□□□□□ -1.57
SRP54P20424 PDB1YBR221C 1101 nt5.27□□□□□ -1.57
SRP54P20424 APC4YDR118W 1959 nt5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.3 ms