Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDSP20132 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDSP20132 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDSP20132 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDSP20132 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDSP20132 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDSP20132 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDSP20132 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDSP20132 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDSP20132 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SDSP20132 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SDSP20132 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDSP20132 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDSP20132 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDSP20132 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDSP20132 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDSP20132 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDSP20132 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDSP20132 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SDSP20132 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDSP20132 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDSP20132 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDSP20132 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SDSP20132 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SDSP20132 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SDSP20132 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SDSP20132 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SDSP20132 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDSP20132 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDSP20132 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDSP20132 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDSP20132 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDSP20132 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SDSP20132 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SDSP20132 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDSP20132 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDSP20132 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDSP20132 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDSP20132 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDSP20132 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SDSP20132 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SDSP20132 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SDSP20132 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SDSP20132 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SDSP20132 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SDSP20132 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SDSP20132 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SDSP20132 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SDSP20132 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SDSP20132 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SDSP20132 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDSP20132 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDSP20132 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDSP20132 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SDSP20132 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDSP20132 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SDSP20132 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SDSP20132 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SDSP20132 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SDSP20132 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SDSP20132 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SDSP20132 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SDSP20132 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SDSP20132 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDSP20132 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDSP20132 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDSP20132 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDSP20132 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SDSP20132 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDSP20132 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDSP20132 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDSP20132 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDSP20132 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDSP20132 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDSP20132 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDSP20132 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDSP20132 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDSP20132 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDSP20132 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDSP20132 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDSP20132 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDSP20132 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDSP20132 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDSP20132 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SDSP20132 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDSP20132 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDSP20132 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms