Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B1P20020 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP2B1P20020 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B1P20020 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms