Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A1P19634 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms