Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD58P19256 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD58P19256 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD58P19256 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD58P19256 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD58P19256 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD58P19256 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD58P19256 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD58P19256 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD58P19256 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD58P19256 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD58P19256 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD58P19256 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD58P19256 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD58P19256 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD58P19256 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD58P19256 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD58P19256 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD58P19256 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD58P19256 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CD58P19256 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD58P19256 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD58P19256 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD58P19256 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD58P19256 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD58P19256 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD58P19256 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD58P19256 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD58P19256 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD58P19256 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD58P19256 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD58P19256 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD58P19256 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD58P19256 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD58P19256 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD58P19256 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD58P19256 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD58P19256 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CD58P19256 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CD58P19256 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CD58P19256 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CD58P19256 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD58P19256 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD58P19256 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD58P19256 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD58P19256 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD58P19256 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD58P19256 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD58P19256 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD58P19256 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD58P19256 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD58P19256 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD58P19256 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD58P19256 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD58P19256 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD58P19256 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD58P19256 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD58P19256 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD58P19256 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD58P19256 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD58P19256 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD58P19256 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD58P19256 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD58P19256 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD58P19256 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD58P19256 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD58P19256 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD58P19256 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD58P19256 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD58P19256 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD58P19256 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD58P19256 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD58P19256 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD58P19256 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD58P19256 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD58P19256 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD58P19256 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD58P19256 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD58P19256 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD58P19256 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD58P19256 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD58P19256 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD58P19256 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD58P19256 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD58P19256 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD58P19256 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD58P19256 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD58P19256 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD58P19256 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD58P19256 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD58P19256 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD58P19256 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD58P19256 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD58P19256 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD58P19256 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD58P19256 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD58P19256 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD58P19256 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD58P19256 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD58P19256 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms