Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI1P19237 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms